Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC59Q9P031 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms