Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXL2Q9NZ53 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms