Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TVP23BQ9NYZ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms