Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MIS18AQ9NYP9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MIS18AQ9NYP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms