Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD3Q9NYL9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms