Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM9Q9NXL9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM9Q9NXL9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms