Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COMMD8Q9NX08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms