Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3EQ9NVU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms