Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL11Q9NVR0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms