Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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