Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF3Q9NUQ8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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