Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRMT13Q9NUP7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT13Q9NUP7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms