Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PDS5BQ9NTI5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PDS5BQ9NTI5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms