Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOPORSQ9NS56 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms