Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS45Q9NRW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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