Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SARS2Q9NP81 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SARS2Q9NP81 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms