Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCQ9H7C4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms