Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms