Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIPK3Q9H422 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms