Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00597Q9H2U6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00597Q9H2U6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00597Q9H2U6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00597Q9H2U6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00597Q9H2U6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00597Q9H2U6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms