Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED28Q9H204 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED28Q9H204 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms