Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms