Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFDQ9GZP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFDQ9GZP0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms