Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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