Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms