Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRTQ9BXP5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRRTQ9BXP5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms