Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms