Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSG101Q99816 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSG101Q99816 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms