Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms