Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC7Q96M83 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC7Q96M83 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms