Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX22Q96L94 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms