Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms