Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM44Q96DX7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms