Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAF2Q96CS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAF2Q96CS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms