Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms