Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms