Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRUNE2Q8WUY3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms