Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP61Q8NHU2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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