Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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