Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms