Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD2AQ8NA29 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms