Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CHCHD4Q8N4Q1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD4Q8N4Q1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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