Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCUBE3Q8IX30 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE3Q8IX30 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms