Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF13Q86YI8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms