Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PBRM1Q86U86 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms