Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY3Q7L099 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms