Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH2Q76I76 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms