Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP26C1Q6V0L0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms