Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SUSD1Q6UWL2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SUSD1Q6UWL2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms