Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWB4

PRSS55, Serine protease 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS55Q6UWB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRSS55Q6UWB4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRSS55Q6UWB4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms